53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3397 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3397  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3313  hypothetical protein  65.06 
 
 
85 aa  116  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.879057  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3042  hypothetical protein  63.41 
 
 
85 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035425  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2955  hypothetical protein  58.44 
 
 
97 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.874724  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2649  hypothetical protein  47.3 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2897  hypothetical protein  48.65 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3259  hypothetical protein  47.37 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0385261  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1613  hypothetical protein  44.59 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17960  hypothetical protein  47.83 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2043  hypothetical protein  45.95 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01019  hypothetical protein  44.74 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00266813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1334  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1762  hypothetical protein  46.48 
 
 
77 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1872  hypothetical protein  45.07 
 
 
79 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106444  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0270  hypothetical protein  47.06 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536604  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0226  hypothetical protein  48.53 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3478  hypothetical protein  44 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1091  hypothetical protein  46.67 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.357178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1518  hypothetical protein  44.59 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2830  hypothetical protein  45.07 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0223  hypothetical protein  47.69 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2723  hypothetical protein  44.59 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2656  hypothetical protein  44.59 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2918  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.67882  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1466  hypothetical protein  41.89 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1436  hypothetical protein  41.89 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.995691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1430  hypothetical protein  41.89 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28460  hypothetical protein  47.14 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3174  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2483  hypothetical protein  45.71 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2186  hypothetical protein  48.57 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1125  hypothetical protein  41.89 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.761879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1896  hypothetical protein  42.86 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1480  hypothetical protein  47.14 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.154498  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3295  hypothetical protein  37.8 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000212918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0499  hypothetical protein  38.67 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3564  hypothetical protein  44.29 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0467  hypothetical protein  43.66 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3324  hypothetical protein  44.93 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3189  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.3436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1356  hypothetical protein  45.71 
 
 
78 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2706  hypothetical protein  45.71 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0979875  normal  0.692275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3103  hypothetical protein  44.29 
 
 
77 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.826821  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0169  hypothetical protein  42.03 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.624405  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01749  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.999492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1254  hypothetical protein  36.84 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2121  hypothetical protein  38.89 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2730  hypothetical protein  45.33 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185514  unclonable  0.000000114972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2247  hypothetical protein  38.67 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.886645  normal  0.845436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3925  hypothetical protein  40.58 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.912444 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002715  hypothetical protein  41.54 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3847  hypothetical protein  43.06 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.52304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1029  hypothetical protein  36.14 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0015753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>