19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1464 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1464  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.904648  normal  0.653495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  81.13 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  73.58 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  73.58 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  70.37 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  54.67 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  67.92 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  67.92 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32820  hypothetical protein  72.34 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  67.92 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  59.65 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  66.04 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  44.44 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2725  protein of unknown function DUF454  55 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  40.74 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  34 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>