13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0835 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0835  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  940    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2399  hypothetical protein  40.43 
 
 		 488 aa  313  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4257  hypothetical protein  35.73 
 
 		 518 aa  262  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal  0.151056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0993  hypothetical protein  34.28 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1847  hypothetical protein  27.75 
 
 		 482 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1816  hypothetical protein  27.9 
 
 		 468 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0238  hypothetical protein  31.73 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0374621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3878  hypothetical protein  29.17 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3925  hypothetical protein  28.67 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1004  hypothetical protein  25.89 
 
 		 470 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1373  hypothetical protein  27.85 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00411865  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2876  hypothetical protein  34.8 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2968  hypothetical protein  33.8 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>