13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2399 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  982    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0835  hypothetical protein  40.43 
 
 		 474 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0993  hypothetical protein  38.43 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4257  hypothetical protein  36.42 
 
 		 518 aa  280  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal  0.151056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0238  hypothetical protein  28.36 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0374621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1847  hypothetical protein  27.74 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3925  hypothetical protein  27.47 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1816  hypothetical protein  28.7 
 
 		 468 aa  153  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3878  hypothetical protein  27.37 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1004  hypothetical protein  25.81 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1373  hypothetical protein  24.56 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00411865  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2876  hypothetical protein  28.01 
 
 		 461 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2968  hypothetical protein  28.42 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>