13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1847 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1816  hypothetical protein  75.33 
 
 
468 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1847  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  983    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1004  hypothetical protein  63.62 
 
 
470 aa  622  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1373  hypothetical protein  51.87 
 
 
478 aa  501  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00411865  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3878  hypothetical protein  40.65 
 
 
460 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3925  hypothetical protein  40.81 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  0.418818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0238  hypothetical protein  40.35 
 
 
466 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0374621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2876  hypothetical protein  35.28 
 
 
461 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2968  hypothetical protein  34.8 
 
 
461 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4257  hypothetical protein  28.54 
 
 
518 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal  0.151056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0993  hypothetical protein  26.29 
 
 
502 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2399  hypothetical protein  27.74 
 
 
488 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0835  hypothetical protein  27.75 
 
 
474 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>