16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2703 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2703  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  882    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0727  hypothetical protein  21.47 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000150296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01583  hypothetical protein  21.37 
 
 
502 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2029  protein of unknown function DUF945  21.37 
 
 
502 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0265099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01573  hypothetical protein  21.37 
 
 
502 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1585  hypothetical protein  22.03 
 
 
502 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1800  hypothetical protein  21.17 
 
 
502 aa  53.5  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1689  hypothetical protein  21.1 
 
 
502 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1822  hypothetical protein  21.1 
 
 
502 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2016  hypothetical protein  21.1 
 
 
502 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235486  normal  0.970517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2324  hypothetical protein  21.75 
 
 
502 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1634  hypothetical protein  21.63 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00065712  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1708  protein YdgA  21.63 
 
 
502 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.366845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1575  hypothetical protein  22 
 
 
502 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.193495  normal  0.310503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1565  protein YdgA  21.79 
 
 
502 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402568  normal  0.107029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1877  hypothetical protein  21.79 
 
 
502 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>