14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2371 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2371  hypothetical protein  100 
 
 
565 aa  1145    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1486  hypothetical protein  30.04 
 
 
425 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0876  hypothetical protein  33.59 
 
 
396 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000487007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1641  hypothetical protein  32.46 
 
 
419 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.992292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2572  hypothetical protein  31.88 
 
 
419 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3098  hypothetical protein  28.61 
 
 
421 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0165  hypothetical protein  28 
 
 
562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.729038  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2516  hypothetical protein  31.73 
 
 
436 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787285  hitchhiker  0.00442526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2564  hypothetical protein  29.95 
 
 
425 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3546  hypothetical protein  27.88 
 
 
570 aa  140  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.149485 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2707  hypothetical protein  29.52 
 
 
542 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.656387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2613  hypothetical protein  29.11 
 
 
542 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0378  hypothetical protein  23.62 
 
 
570 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000222085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1251  hypothetical protein  34.45 
 
 
542 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.505156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>