15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0378 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1162    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000222085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1486  hypothetical protein  30.82 
 
 		 425 aa  144  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1641  hypothetical protein  28.18 
 
 		 419 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.992292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2572  hypothetical protein  28.41 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0165  hypothetical protein  27.81 
 
 		 562 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.729038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3098  hypothetical protein  27.08 
 
 		 421 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2371  hypothetical protein  23.62 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0876  hypothetical protein  27.06 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000487007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2564  hypothetical protein  25.06 
 
 		 425 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2516  hypothetical protein  25.41 
 
 		 436 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787285  hitchhiker  0.00442526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3546  hypothetical protein  23.54 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.149485 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2613  hypothetical protein  25.17 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.63644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2707  hypothetical protein  24.72 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.656387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1251  hypothetical protein  25 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.505156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4367  hypothetical protein  29.47 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0103259  normal  0.567988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>