17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1581 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1581  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  413  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1957  hypothetical protein  58.72 
 
 
130 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2301  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.594311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1685  hypothetical protein  39.67 
 
 
136 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0573  hypothetical protein  40.91 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0446  hypothetical protein  34.95 
 
 
125 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04760  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  63.64 
 
 
149 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000206587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0196  hypothetical protein  51.43 
 
 
93 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1150  hypothetical protein  44.44 
 
 
201 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1124  hypothetical protein  25.23 
 
 
136 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0628  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.57 
 
 
419 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0599345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1003  hypothetical protein  38 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2429  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29 
 
 
119 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0830  hypothetical protein  54.29 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125088  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18360  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.45 
 
 
113 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000074108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1249  protein of unknown function DUF134  45.45 
 
 
155 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.928642  normal  0.573446 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1343  protein of unknown function DUF134  50 
 
 
157 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>