26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1168 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1168  Miro domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1967  Miro domain-containing protein  80.5 
 
 
161 aa  251  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.159155  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0786  Miro domain-containing protein  77.99 
 
 
161 aa  249  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.851567  normal  0.0100906 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0864  Miro domain-containing protein  77.36 
 
 
161 aa  249  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.923608  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1638  hypothetical protein  62 
 
 
152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1851  hypothetical protein  57.32 
 
 
171 aa  189  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.669352 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1801  hypothetical protein  61.15 
 
 
158 aa  185  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0725157 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0481  hypothetical protein  61.19 
 
 
135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.158904  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1716  Miro domain-containing protein  57.43 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.59336  normal  0.0482375 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1602  Miro domain-containing protein  49.37 
 
 
164 aa  168  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288028  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1536  Miro domain-containing protein  56.21 
 
 
168 aa  167  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1761  Miro domain-containing protein  56.34 
 
 
170 aa  156  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000132289 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0632  Miro domain-containing protein  49.65 
 
 
167 aa  145  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.30588  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0171  Miro domain-containing protein  52.26 
 
 
162 aa  142  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0906  Miro domain-containing protein  49.39 
 
 
165 aa  141  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2034  Miro domain-containing protein  52.67 
 
 
163 aa  135  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.517441  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1252  hypothetical protein  46.71 
 
 
165 aa  135  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.326878  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0547  hypothetical protein  50.94 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0103683 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0860  Miro domain-containing protein  38.13 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1871  hypothetical protein  56.14 
 
 
80 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.889407  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  28.74 
 
 
647 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  25.58 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  26.95 
 
 
300 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  26.88 
 
 
783 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  30.16 
 
 
313 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1429  ferrous iron transport protein B  27.22 
 
 
697 aa  40.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>