10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0106 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0106  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00415315 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1173  hypothetical protein  77.14 
 
 
211 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0129  hypothetical protein  80 
 
 
210 aa  352  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.392648  hitchhiker  0.00225213 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0137  hypothetical protein  71.15 
 
 
209 aa  325  3e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.314287  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1961  hypothetical protein  48.8 
 
 
228 aa  216  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0525  hypothetical protein  29.01 
 
 
187 aa  48.5  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  29.35 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1126  hypothetical protein  36.46 
 
 
133 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000923187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0078  hypothetical protein  36.08 
 
 
134 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.149247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  29.35 
 
 
229 aa  41.6  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>