16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1100 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1094  GumL  80.29 
 
 		 274 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  43.94 
 
 		 264 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  31.73 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  29.15 
 
 		 625 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  30.22 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  27.21 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  27.31 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  26.56 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4937  hypothetical protein  26.79 
 
 		 696 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  27.39 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4949  ExoV-like protein  25.68 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.831937  normal  0.31532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4913  ExoV-like protein  26.99 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  25.17 
 
 		 333 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  25 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  28.09 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>