17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4804 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  100 
 
 
333 aa  671    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0650  ketal pyruvate transferase protein  31.55 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4949  ExoV-like protein  36.99 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.831937  normal  0.31532 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3832  succinoglycan biosynthesis ketolase  35.17 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2966  ExoV-like protein  36.19 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0575869  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  30.33 
 
 
321 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3215  ExoV-like protein  32.29 
 
 
300 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4913  ExoV-like protein  30.5 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  27.43 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  25.45 
 
 
271 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  26.17 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  26.79 
 
 
266 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  23.81 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  25.17 
 
 
274 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  26.72 
 
 
264 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  28.77 
 
 
625 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1094  GumL  26.49 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>