17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07265 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  100 
 
 
277 aa  565  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  26.5 
 
 
390 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  25.32 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  32.49 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  26.56 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1094  GumL  28.1 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.84 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  21.4 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  26.05 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4949  ExoV-like protein  24.23 
 
 
316 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.831937  normal  0.31532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  22.36 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  27.85 
 
 
625 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4913  ExoV-like protein  25.37 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0650  ketal pyruvate transferase protein  25.29 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2966  ExoV-like protein  22.97 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0575869  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2549  hypothetical protein  35.94 
 
 
383 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3832  succinoglycan biosynthesis ketolase  27.59 
 
 
304 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>