16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0532 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0532  lipoprotein, putative  100 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1365  plasmid protein  43.75 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.579971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1300  hypothetical protein  45.61 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1529  hypothetical protein  40.54 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000363853  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6327  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0762  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0253  hypothetical protein  37.14 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.928272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2353  hypothetical protein  34.52 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0771  hypothetical protein  45.83 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5084  hypothetical protein  38.81 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4344  hypothetical protein  40.62 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2659  hypothetical protein  38.6 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00423617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0448  hypothetical protein  38.6 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1223  hypothetical protein  39.39 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000369235  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08211  hypothetical protein  39.29 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2234  hypothetical protein  35.09 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>