13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0253 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0253  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.928272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0532  lipoprotein, putative  37.14 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1529  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000363853  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2353  hypothetical protein  37.21 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0679  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1365  plasmid protein  37.33 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.579971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1300  hypothetical protein  44.64 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0752  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5084  hypothetical protein  42.5 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4344  hypothetical protein  35 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0762  hypothetical protein  47.37 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1223  hypothetical protein  44.9 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000369235  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2659  hypothetical protein  30.88 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00423617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0448  hypothetical protein  30.88 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00187665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>