11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2353 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2353  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  170  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1223  hypothetical protein  57.75 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000369235  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0253  hypothetical protein  37.21 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.928272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0679  hypothetical protein  48.53 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0532  lipoprotein, putative  34.52 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0018  cpp23  34.67 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.156751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1529  hypothetical protein  36.47 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000363853  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5084  hypothetical protein  43.55 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0762  hypothetical protein  36.71 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4344  hypothetical protein  55 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1365  plasmid protein  35.9 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.579971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>