19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5399 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5399  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4530  hypothetical protein  46.31 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5055  hypothetical protein  45.9 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1600  hypothetical protein  46.18 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0669  hypothetical protein  46.18 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0722069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2162  hypothetical protein  46.18 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2246  hypothetical protein  46.18 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1991  hypothetical protein  46.18 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0644  hypothetical protein  46.18 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5117  hypothetical protein  46.72 
 
 		 299 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3251  hypothetical protein  46.72 
 
 		 324 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3518  hypothetical protein  45.08 
 
 		 301 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5164  hypothetical protein  46.72 
 
 		 299 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0781  hypothetical protein  45.78 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0518  hypothetical protein  45.9 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000194599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3932  hypothetical protein  44.9 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3744  hypothetical protein  44.62 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.684029  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2250  hypothetical protein  38.24 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0764238  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0038  hypothetical protein  38.81 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>