19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5055 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5055  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4530  hypothetical protein  99 
 
 
300 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401387  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5164  hypothetical protein  93.36 
 
 
299 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3251  hypothetical protein  93.36 
 
 
324 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5117  hypothetical protein  93.36 
 
 
299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0518  hypothetical protein  93.02 
 
 
299 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000194599  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3518  hypothetical protein  89.04 
 
 
301 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1600  hypothetical protein  76.77 
 
 
267 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0669  hypothetical protein  76.77 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0722069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2162  hypothetical protein  76.77 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2246  hypothetical protein  76.77 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1991  hypothetical protein  76.77 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0781  hypothetical protein  74.52 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0644  hypothetical protein  76.77 
 
 
266 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3932  hypothetical protein  75.5 
 
 
273 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5399  hypothetical protein  45.9 
 
 
256 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3744  hypothetical protein  33.51 
 
 
228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.684029  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2250  hypothetical protein  30.04 
 
 
273 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0764238  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0038  hypothetical protein  32.99 
 
 
212 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>