20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3744 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3744  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  471  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.684029  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0038  hypothetical protein  42.79 
 
 
212 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5399  hypothetical protein  44.62 
 
 
256 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3932  hypothetical protein  37.17 
 
 
273 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0518  hypothetical protein  35.08 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000194599  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3251  hypothetical protein  36.36 
 
 
324 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5164  hypothetical protein  36.13 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.148396 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5117  hypothetical protein  36.13 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4530  hypothetical protein  34.03 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401387  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3518  hypothetical protein  34.55 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0781  hypothetical protein  35.08 
 
 
266 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5055  hypothetical protein  33.51 
 
 
300 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1991  hypothetical protein  34.55 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0669  hypothetical protein  34.55 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0722069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2162  hypothetical protein  34.55 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2246  hypothetical protein  34.55 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0644  hypothetical protein  34.55 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1600  hypothetical protein  34.55 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2250  hypothetical protein  36.08 
 
 
273 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0764238  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3742  hypothetical protein  26.07 
 
 
186 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149032  normal  0.132683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>