12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2629 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2132  hypothetical protein  95.83 
 
 		 496 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3202  putative protease  84.89 
 
 		 496 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0079  cellulose biosynthesis protein BcsE  33.88 
 
 		 534 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0076  cellulose biosynthesis protein BcsE  36.44 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0145  hypothetical protein  29.68 
 
 		 522 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3845  hypothetical protein  25.34 
 
 		 519 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.725838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03384  hypothetical protein  24.32 
 
 		 523 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0177  cellulose biosynthesis protein BcsE  24.32 
 
 		 519 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0180  putative protease  24.32 
 
 		 519 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03337  hypothetical protein  24.32 
 
 		 523 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.362213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4902  hypothetical protein  24.32 
 
 		 519 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>