16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1550 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1550  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 58 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3267  hypothetical protein  60.38 
 
 		 67 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000286542  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2562  hypothetical protein  61.54 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1966  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3494  hypothetical protein  61.54 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000638344  unclonable  0.00000710408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0741  hypothetical protein  54.72 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3370  hypothetical protein  61.54 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000378314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0769  hypothetical protein  54.72 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0768  hypothetical protein  56.6 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.100263  normal  0.245457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3615  hypothetical protein  54.72 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0550538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2021  hypothetical protein  52.83 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0532062  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10022  Regulatory protein cro (Antirepressor)  50.98 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1649  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00359751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0290  regulatory protein Cro  50.98 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2621  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103898 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2247  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>