24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10022 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10022  Regulatory protein cro (Antirepressor)  100 
 
 		 61 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0290  regulatory protein Cro  100 
 
 		 61 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1422  DNA-binding transcriptional regulator DicC  47.37 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3168  DNA-binding transcriptional regulator DicC  47.37 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000339989  hitchhiker  5.09269e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1831  DNA-binding transcriptional regulator DicC  47.37 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000135979  hitchhiker  0.000000000000143689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1159  DNA-binding transcriptional regulator DicC  47.37 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630575  hitchhiker  4.7750399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2247  hypothetical protein  46.67 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3370  hypothetical protein  46.3 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000378314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2562  hypothetical protein  48.15 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3494  hypothetical protein  46.3 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000638344  unclonable  0.00000710408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3267  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000286542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1649  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00359751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0768  hypothetical protein  48.94 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.100263  normal  0.245457 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0769  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0741  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1966  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1550  Cro/CI family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2021  hypothetical protein  46.67 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0532062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3615  hypothetical protein  46.67 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0550538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1754  DNA-binding transcriptional regulator DicC  36.84 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163478  hitchhiker  0.000166597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01538  transcriptional repressor of cell division inhibition protein  36.84 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1777  DNA-binding transcriptional regulator DicC  36.21 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2059  DNA-binding transcriptional regulator DicC  36.21 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26685  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2074  DNA-binding transcriptional regulator DicC  36.21 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>