22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1676 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1676  CpeT protein  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0329357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03901  CpeT  95.98 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0448364  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22311  CpeT  38.89 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1887  CpeT-like  39.9 
 
 		 204 aa  164  5e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0944089  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03371  hypothetical protein  43.58 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0440  CpeT-like  38.69 
 
 		 204 aa  157  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5722  protein of unknown function DUF1001  36.65 
 
 		 204 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4526  protein of unknown function DUF1001  33.51 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.390851  normal  0.829315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2579  hypothetical protein  34.62 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.755501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0979  hypothetical protein  32.26 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0600583  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0800  hypothetical protein  33.87 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5043  hypothetical protein  36.07 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.968769  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0272  protein of unknown function DUF1001  32.42 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1417  protein of unknown function DUF1001  32.42 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.83474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1383  protein of unknown function DUF1001  32.42 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2275  hypothetical protein  32.42 
 
 		 198 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3679  protein of unknown function DUF1001  31.87 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0419  hypothetical protein  30.57 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0631886  normal  0.0277692 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1910  hypothetical protein  28.43 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5176  protein of unknown function DUF1001  24.62 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4579  hypothetical protein  24.6 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0772  hypothetical protein  22.28 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.101942  normal  0.37279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>