23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5722 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5722  protein of unknown function DUF1001  100 
 
 
204 aa  429  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4526  protein of unknown function DUF1001  70.47 
 
 
200 aa  300  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.390851  normal  0.829315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0979  hypothetical protein  49.23 
 
 
209 aa  205  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0600583  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0440  CpeT-like  48.7 
 
 
204 aa  193  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22311  CpeT  48.97 
 
 
204 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1887  CpeT-like  48.92 
 
 
204 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0944089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2579  hypothetical protein  44.56 
 
 
199 aa  171  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.755501  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03371  hypothetical protein  42.61 
 
 
192 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0272  protein of unknown function DUF1001  41.75 
 
 
196 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1417  protein of unknown function DUF1001  41.75 
 
 
196 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.83474  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1383  protein of unknown function DUF1001  41.75 
 
 
196 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0800  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3679  protein of unknown function DUF1001  41.08 
 
 
195 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2275  hypothetical protein  40.64 
 
 
198 aa  148  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5043  hypothetical protein  40.43 
 
 
195 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.968769  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03901  CpeT  38.02 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0448364  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1676  CpeT protein  36.65 
 
 
199 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0329357  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1910  hypothetical protein  32.46 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0419  hypothetical protein  32.6 
 
 
208 aa  87.8  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0631886  normal  0.0277692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4579  hypothetical protein  28.12 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5176  protein of unknown function DUF1001  26.63 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0772  hypothetical protein  29.95 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.101942  normal  0.37279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2712  hypothetical protein  24.55 
 
 
354 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.334178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>