18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0842 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0842  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  634    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16961  hypothetical protein  96.57 
 
 
321 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19411  hypothetical protein  58.68 
 
 
345 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13211  hypothetical protein  49.83 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.599208 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1504  hypothetical protein  52.82 
 
 
282 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0894  hypothetical protein  54.74 
 
 
319 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2523  protein of unknown function DUF1517  38.94 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5044  hypothetical protein  37.68 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1059  hypothetical protein  39.01 
 
 
310 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120291  normal  0.0451047 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3844  hypothetical protein  35.76 
 
 
320 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0133896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2906  protein of unknown function DUF1517  38.42 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35945  predicted protein  34.92 
 
 
212 aa  109  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1471  hypothetical protein  36.07 
 
 
322 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0587005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6796  protein of unknown function DUF1517  27.63 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2250  hypothetical protein  24.22 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000129239  normal  0.0239779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2624  protein of unknown function DUF1517  24.36 
 
 
300 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45612  predicted protein  23.7 
 
 
497 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32071  predicted protein  24.28 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.689163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>