19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2250 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2250  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000129239  normal  0.0239779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2624  protein of unknown function DUF1517  56.67 
 
 
300 aa  272  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2906  protein of unknown function DUF1517  29.73 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1471  hypothetical protein  32.57 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0587005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3844  hypothetical protein  28.39 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0133896  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5044  hypothetical protein  30.77 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2523  protein of unknown function DUF1517  26.88 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1059  hypothetical protein  28.96 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120291  normal  0.0451047 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13211  hypothetical protein  26.94 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.599208 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19411  hypothetical protein  29.67 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1504  hypothetical protein  29.51 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0894  hypothetical protein  28.42 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35945  predicted protein  29.83 
 
 
212 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0842  hypothetical protein  25.41 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16961  hypothetical protein  25.95 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6796  protein of unknown function DUF1517  26.22 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45612  predicted protein  22.79 
 
 
497 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32071  predicted protein  23.12 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.689163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0328  hypothetical protein  29.88 
 
 
199 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>