14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82300 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_82300  predicted protein  100 
 
 
516 aa  1074    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284716  normal  0.810962 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10956  histone acetyltransferase catalytic subunit (Eurofung)  47.56 
 
 
508 aa  458  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0558493  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03160  hypothetical protein  40.87 
 
 
564 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33631  predicted protein  37.47 
 
 
412 aa  293  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0827491  normal  0.813084 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34656  predicted protein  32.64 
 
 
417 aa  263  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0290177  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3062  predicted protein  40.62 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0291461  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51406  predicted protein  38.39 
 
 
297 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.608395  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05640  histone acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10910)  40.63 
 
 
1068 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.814217  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00240  conserved hypothetical protein  45.69 
 
 
940 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0793418  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50903  predicted protein  41.9 
 
 
553 aa  231  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42025  predicted protein  37.74 
 
 
458 aa  221  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.067727  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00500  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 
584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03071  histone acetyltransferase (MysT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09610)  33.1 
 
 
363 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.605108 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29380  predicted protein  31.23 
 
 
357 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.0000000817876  normal  0.405165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>