21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60934 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60934  predicted protein  100 
 
 
696 aa  1441    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0473151  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04486  Zn(II)2Cys6 transcriptional activator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q699N9]  27.6 
 
 
731 aa  224  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0207332  normal  0.183853 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04744  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25.34 
 
 
592 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000672297  normal  0.0366017 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82707  predicted protein  21.07 
 
 
901 aa  98.2  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07596  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  20.25 
 
 
667 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.778047  normal  0.314909 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30764  Suppressor of Essential Function  21.76 
 
 
601 aa  70.5  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.829128  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62972  putative transcription factor  24.04 
 
 
649 aa  59.7  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.150077 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06396  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.14 
 
 
772 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00359431  normal  0.0434138 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00690  expressed protein  27.21 
 
 
736 aa  51.2  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09147  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.77 
 
 
920 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0074212  normal  0.259032 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10120  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  23.37 
 
 
733 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06173  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  35.87 
 
 
772 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08590  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.21 
 
 
953 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03650  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.59 
 
 
815 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653785 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02785  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.11 
 
 
600 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00388  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25 
 
 
825 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00420  expressed protein  28.12 
 
 
730 aa  44.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65252  putative transcriptional regulatory protein  35.48 
 
 
674 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.361708 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57167  Fungal specific transcription factor  32.93 
 
 
713 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.256805  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07189  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.34 
 
 
697 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04175  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.86 
 
 
973 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.163243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>