12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39006 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_39006  CCAAT-binding factor, subunit A (HAP3)  100 
 
 		 124 aa  260  4e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191665  normal  0.0696406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04034  transcription factor HapC (Eurofung)  71.13 
 
 		 219 aa  155  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.803241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68494  Transcriptional activator HAP3 (UAS2 regulatory protein A)  70.3 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.342746  normal  0.0633704 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03260  transcriptional activator, putative  72.63 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.496559  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54067  histone-like transcription factor  67.02 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237044  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35958  predicted protein  64.65 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13665  Class 2 transcription repressor NC2, beta subunit (Dr1)  31.4 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.379904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03250  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09358  putative CCAAT-box-binding transcription factor (Eurofung)  32.97 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.015169 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43730  predicted protein  28.92 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606428  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8911  predicted protein  30.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0719677  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32755  predicted protein  25 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.835255  normal  0.0992393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>