11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46645 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46645  predicted protein  100 
 
 
377 aa  781    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10293  predicted protein  46.21 
 
 
289 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0891574  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16105  predicted protein  28.93 
 
 
272 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0443803  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02700  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
796 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.738564  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3819  predicted protein  26.57 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4198  predicted protein  26.81 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11183  predicted protein  29.2 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.621413  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63490  predicted protein  22.9 
 
 
553 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06328  DUF300 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13512)  25.11 
 
 
490 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622915  normal  0.106438 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00410  hypothetical protein  24.68 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0252684  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02232  DUF300 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07250)  23.3 
 
 
542 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.826222  hitchhiker  0.00608886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>