23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49142 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49142  predicted protein  100 
 
 		 322 aa  657    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  26.96 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.45 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  26.96 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  26.96 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.96 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  26.96 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  28 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  28 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  28 
 
 		 347 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  28.49 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.49 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88172  predicted protein  25.32 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.123803  normal  0.573363 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  27.5 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  26.4 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.92 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  26.29 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  28.21 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  26.04 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  26.26 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  26.29 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>