16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46110 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46110  core alphafucosyltransferase  100 
 
 
718 aa  1499    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46109  predicted protein  29.32 
 
 
770 aa  217  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27069  predicted protein  34.35 
 
 
708 aa  79.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00126947  hitchhiker  0.00000912113 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0760  hypothetical protein  32.56 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93448  predicted protein  34.93 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589852  normal  0.258864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13921  hypothetical protein  32.94 
 
 
338 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54599  predicted protein  29.1 
 
 
481 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00132596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0149  hypothetical protein  30.58 
 
 
320 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1042  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  27.61 
 
 
309 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0622  putative transferase  24.84 
 
 
320 aa  51.6  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1869  hypothetical protein  32.91 
 
 
355 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3056  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  27.87 
 
 
287 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3255  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  28.71 
 
 
287 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.781158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1948  glycosyl transferase  31.96 
 
 
323 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.703364  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0323  glycosyl transferase  32.91 
 
 
324 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.221565  normal  0.708301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2901  putative glycosyl transferase  27.93 
 
 
318 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.344116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>