19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43708 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43708  predicted protein  100 
 
 
501 aa  1042    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15174  predicted protein  36.63 
 
 
253 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000235527  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50541  predicted protein  39.77 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05998  SET and MYND domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10080)  42.5 
 
 
497 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10915  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0251863  normal  0.0913567 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63965  predicted protein  34.62 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
638 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48486  predicted protein  43.04 
 
 
528 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178439  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19605  predicted protein  31.71 
 
 
375 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03780  conserved hypothetical protein  30.39 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92854  predicted protein  37.35 
 
 
639 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.798313  normal  0.0275457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  40 
 
 
155 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_17964  predicted protein  28.83 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31845  predicted protein  34.52 
 
 
654 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  40.85 
 
 
163 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2161  nuclear protein SET  48.72 
 
 
196 aa  44.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2561  nuclear protein SET  48.72 
 
 
197 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  53.85 
 
 
252 aa  43.9  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3964  nuclear protein SET  38.03 
 
 
177 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.0564126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>