14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42942 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42942  predicted protein  100 
 
 		 1474 aa  3038    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44023  predicted protein  29.66 
 
 		 1308 aa  155  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392066  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44845  predicted protein  29.49 
 
 		 1264 aa  134  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04349  dDENN domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06480)  35.38 
 
 		 1125 aa  99  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.248828 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01890  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 888 aa  73.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37502  predicted protein  35.48 
 
 		 299 aa  71.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86011  predicted protein  29.95 
 
 		 1301 aa  70.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00575  DENN (AEX-3) domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11200)  25.6 
 
 		 902 aa  67.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0606127 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27205  predicted protein  38.75 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0162188 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29704  predicted protein  38.75 
 
 		 518 aa  58.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0581528  hitchhiker  0.00877603 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42592  predicted protein  31.33 
 
 		 1181 aa  51.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243609  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21791  predicted protein  36.79 
 
 		 208 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0609833  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04274  ARF GTPase activator (Csx2), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03790)  30.93 
 
 		 1113 aa  45.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.200938  normal  0.10616 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01931  stromal membrane-associated protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07830)  29.57 
 
 		 565 aa  45.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.283365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>