10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42542 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42542  predicted protein  100 
 
 
304 aa  635    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31558  predicted protein  45.63 
 
 
246 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37648  predicted protein  32.43 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28008  predicted protein  30.92 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.133273 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15768  predicted protein  28 
 
 
187 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84430  predicted protein  25.19 
 
 
400 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46123  predicted protein  47.92 
 
 
434 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06410  vacuole protein, putative  32.26 
 
 
644 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42854  predicted protein  32.86 
 
 
768 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652023  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45411  predicted protein  23.28 
 
 
406 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>