26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35395 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35395  predicted protein  100 
 
 
176 aa  368  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0170226  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37938  predicted protein  37.5 
 
 
866 aa  57.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.590439  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54983  predicted protein  32.63 
 
 
891 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29549  predicted protein  38.71 
 
 
80 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.20834  normal  0.032928 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12783  predicted protein  36.36 
 
 
517 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00554714 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31632  outer mitochondrial membrane isoform  32.14 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0689191 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02030  cytochrome b5, putative  29.27 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0489615  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
503 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11632 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  29.41 
 
 
490 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9095  predicted protein  34.67 
 
 
72 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143106  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88841  predicted protein  38.1 
 
 
491 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000434315  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  41.86 
 
 
555 aa  45.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30770  predicted protein  31.71 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  32.81 
 
 
635 aa  44.3  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01006  Nitrate reductase [NADPH] (NR)(EC 1.7.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22945]  29.58 
 
 
873 aa  44.3  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01230  cytochrome b2, mitochondrial precursor, putative  41.86 
 
 
593 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  40.43 
 
 
627 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08920  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 
458 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487731 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_9043  predicted protein  41.67 
 
 
74 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15110  predicted protein  40.38 
 
 
498 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779867  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08449  nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10420)  36.21 
 
 
1016 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.92163  normal  0.772146 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05828  cytochrome b5, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07720)  28.21 
 
 
84 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  37.21 
 
 
552 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03862  cytochrome b5 reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10060)  30.49 
 
 
510 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.365477  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  40.43 
 
 
500 aa  41.2  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29488  delta 6 fatty acid desaturase  32 
 
 
477 aa  40.8  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>