19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33873 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33873  predicted protein  100 
 
 
314 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33874  predicted protein  59.92 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33730  predicted protein  45.02 
 
 
402 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00194424  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42740  predicted protein  38.25 
 
 
290 aa  142  9e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181506  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43507  predicted protein  29.46 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44608  predicted protein  25.84 
 
 
1115 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44648  predicted protein  37.42 
 
 
245 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43397  predicted protein  26.97 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00959094  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49068  predicted protein  31.93 
 
 
1472 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50419  predicted protein  27.8 
 
 
345 aa  62.4  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49062  predicted protein  26.67 
 
 
356 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.956342  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43508  predicted protein  30.29 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48701  predicted protein  26.94 
 
 
615 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48695  predicted protein  26.75 
 
 
972 aa  53.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48700  predicted protein  25.91 
 
 
509 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.877799  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34469  predicted protein  32.48 
 
 
464 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43396  predicted protein  27.5 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0039588  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43395  predicted protein  25.86 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319508  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44923  predicted protein  37.8 
 
 
723 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>