18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43396 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43395  predicted protein  94.29 
 
 
385 aa  758    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0319508  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43396  predicted protein  100 
 
 
383 aa  800    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0039588  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43397  predicted protein  35.47 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00959094  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43508  predicted protein  30.66 
 
 
394 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43507  predicted protein  32.25 
 
 
376 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44608  predicted protein  33.33 
 
 
1115 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44648  predicted protein  41.53 
 
 
245 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49068  predicted protein  28.52 
 
 
1472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34469  predicted protein  27.21 
 
 
464 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48696  predicted protein  27.76 
 
 
853 aa  94.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49062  predicted protein  27.72 
 
 
356 aa  92.8  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.956342  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48695  predicted protein  25.64 
 
 
972 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48701  predicted protein  22.71 
 
 
615 aa  82.8  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48700  predicted protein  24.63 
 
 
509 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.877799  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44923  predicted protein  26.39 
 
 
723 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50419  predicted protein  28.14 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42740  predicted protein  26.33 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181506  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33873  predicted protein  27.5 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>