11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18945 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_18945  transport protein  100 
 
 		 562 aa  1135    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163765  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30525  predicted protein  33.48 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186361  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16421  predicted protein  34.79 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42677  predicted protein  31.16 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3784  predicted protein  30.41 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.461536  normal  0.270485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4159  MFS permease  31.62 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  36.67 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 474 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.03 
 
 		 480 aa  44.3  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1001  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 470 aa  43.5  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141392  normal  0.0130853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 456 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>