17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12884 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12884  predicted protein  100 
 
 
417 aa  873    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_2215  predicted protein  50.7 
 
 
415 aa  412  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11390  predicted protein  49.16 
 
 
400 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46154  predicted protein  42.32 
 
 
427 aa  298  8e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17319  predicted protein  42.62 
 
 
455 aa  282  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  normal  0.072463 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43116  predicted protein  38.74 
 
 
726 aa  229  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00100373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  23.66 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0486  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.062734  hitchhiker  0.000000303722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2155  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150304  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
385 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
393 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
476 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>