10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_61270  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5277  hypothetical protein  97.96 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3667  hypothetical protein  71.43 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  21.71 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  21.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  28.43 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  27.27 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  26.12 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  31.33 
 
 		 151 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>