15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3667 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  308  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5277  hypothetical protein  72.11 
 
 		 147 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61270  hypothetical protein  71.43 
 
 		 147 aa  227  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  29.63 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  34.74 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  27.12 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.83 
 
 		 316 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  24.49 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  20.74 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  25.45 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  20.74 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  30.12 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  28.38 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2486  hypothetical protein  24.74 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.183485  normal  0.284037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>