7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4560 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4560  conjugal transfer protein  100 
 
 
240 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6403  conjugal transfer protein  81.93 
 
 
233 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9818  hypothetical protein  70.04 
 
 
232 aa  329  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4175  conjugal transfer protein  63.64 
 
 
231 aa  301  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0769279  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4443  conjugal transfer protein  44.98 
 
 
239 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228705  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6208  conjugal transfer protein  37.11 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.173405 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4444  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.457311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>