7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4175 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4175  conjugal transfer protein  100 
 
 		 231 aa  460  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0769279  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4560  conjugal transfer protein  64.98 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9818  hypothetical protein  60 
 
 		 232 aa  285  5e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6403  conjugal transfer protein  59.57 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4443  conjugal transfer protein  42.57 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228705  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6208  conjugal transfer protein  30.73 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.726162  normal  0.173405 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4444  hypothetical protein  31.87 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.457311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>