9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0035 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0035  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0062  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0006  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168855  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  88.46 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  86.54 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0003  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106798  normal  0.35233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0037  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.897557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>