21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0006 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_R0062  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0006  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168855  normal  0.285381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0023  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0051  tRNA-Thr  96.77 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0035  tRNA-Thr  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0038  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0021  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00687785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0017  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0090775  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0014  tRNA-Arg  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000764457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0054  tRNA-Thr  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0012  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0586  tRNA-Arg  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14009  tRNA-Thr  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0198  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>