12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0009 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0308  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0013  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.223557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00148219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.950757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>