43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4418 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4418  mercuric ion transport protein, MerT  100 
 
 		 125 aa  249  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0799  mercuric transporter MerT  46.15 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.895967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3157  mercuric transporter MerT  44.44 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2901  mercuric transporter MerT  42.19 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2510  mercuric transporter MerT  41.73 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2327  mercuric transporter MerT  38.83 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2685  mercuric transporter MerT  36.36 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2270  putative mercuric transport protein  34.71 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4013  putative mercuric transport protein  32.76 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4314  mercuric transporter MerT  39.02 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0093  putative mercuric transport protein  34.82 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  34.29 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  34.82 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  34.29 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0239  putative mercuric transport protein  33.64 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  34.29 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1475  putative mercuric transport protein  34 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  34.29 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1212  Mercuric transport protein MerT  33.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.158107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0170  mercuric transporter MerT  36.62 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02957  MerT mercuric transport protein  37.66 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  30.23 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  34.29 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  34.29 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  31.48 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0082  putative mercuric transport protein  33.93 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.680635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2130  putative mercuric transport protein  33.93 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.981887  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  49.06 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01411  putative mercuric transport protein  37.5 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.658716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1394  putative mercuric transport protein  44.26 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2231  putative mercuric transport protein  31.86 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751686  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3491  mercuric transporter MerT  45.28 
 
 		 115 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1662  Hg2+ uptake ATPase  42.86 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253887  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0167  putative mercuric transport protein  42.25 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1300  putative mercuric transport protein  51.79 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.703768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1784  putative mercuric transport protein  44.62 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598892  normal  0.981722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2313  putative mercuric transport protein  52.73 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214741  hitchhiker  0.0000267123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0485  putative mercuric transport protein  36.08 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  34.02 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4797  putative mercuric transport protein  46.94 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0114  mercuric transport protein  41.18 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  29.17 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  31.36 
 
 		 372 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>