18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4099 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4099    100 
 
 		 708 bp  1403    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4103  protein of unknown function DUF347  78.78 
 
 		 777 bp  165  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0054  hypothetical protein  93.75 
 
 		 780 bp  95.6  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0571188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  93.75 
 
 		 789 bp  71.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  93.33 
 
 		 756 bp  65.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5325  major facilitator protein family permease  95.12 
 
 		 765 bp  65.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0257  hypothetical protein  84.93 
 
 		 810 bp  58  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  92.11 
 
 		 759 bp  52  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  92.11 
 
 		 759 bp  52  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  92.11 
 
 		 759 bp  52  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2662  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.339313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2116  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0967  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.549462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0963  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.387944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1037  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2246  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0647125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2752  hypothetical protein  84.38 
 
 		 810 bp  48.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1118  hypothetical protein  85.71 
 
 		 783 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>